在未来的东京，科技高度发达，空间资源极其紧张，人们的日常生活都被压缩在一个个小小的胶囊旅馆中。年轻女科学家千岛瑞子偶然接触到一项被封存的研究——“心灵胶囊”。这项研究曾经试图将人类的记忆和情感数字化，以缓解人们日益严重的精神压力，但由于实验失败，被认为过于危险而被终止。出于好奇和学术挑战，瑞子决定秘密从事这项研究。在研究的过程中，她意外打开了一扇心灵世界的大门，通过心灵胶囊与住在相邻房间的旅客——一位患有严重焦虑症的年轻画家小林逐渐建立起深刻的心灵连接。他们在胶囊中穿越记忆和想象的迷宫，一同体验被压抑的情感，找回遗失的真实自我。与此同时，瑞子的研究引起了一个大财团的注意，他们希望以此控制大众意识，进而影响社会行为。随着各方势力的介入，瑞子和小林陷入了一场关于记忆、真实与未来自由的斗争中。电影通过别致的视觉风格和富有哲思的剧情，引导观众思考心灵自由的真谛。
